Året er 1955. I en fattig palestinsk landsby blir 12 år gamle Ichmad vitne til at lillesøsteren drepes av en landmine. Ikke lenge etterpå blir faren arrestert, og Ichmads største frykt blir en realitet: både huset og appelsinlunden som er familiens levebrød konfiskeres, noe som tvinger dem til et liv i fattigdom. Han bestemmer seg for å redde familien sin, og kommer nærmere målet da han blir tildelt et universitetsstipend. Dette blir begynnelsen på en reise som konfronterer Ichmad med gamle fordommer og utfordrer hans syn på andre mennesker.
Mandeltreet er en gripende og sterk beretning, som også er full av håp og optimisme. 1955. I en fattig palestinsk landsby, underlagt israelsk militærstyre, blir den 12 år gamle Ichmad vitne til at lillesøsteren på grusomt vis blir drept av en landmine. Kort tid etter blir faren arrestert, og familiens levebrød, den frodige appelsinlunden, og hjemmet deres konfiskeres. Familien tvinges til et liv i fattigdom - et liv preget av frykt og uvisshet. Ichmad er fast bestemt på å forsørge familien, og han får etter hvert et universitetsstipend. Dette fører ham ut i en verden hvor han møter mange fordommer, men som også gir ham store muligheter.