Når et skjelett blir funnet gjemt i en gotisk viktoriansk bygning under renovering, blir sjefsetterforsker Karen Pirie satt på saken. Hun skal forsøke å identifisere de gamle benrestene, og etterforskningen fører Pirie inn i gamle konflikter, falske identiteter og begravde hemmeligheter.
Skjelettets vei foregår i Val McDermids hjemby, Edinburgh, og handler om etterforskningen av en såkalt cold case. Et skjelett blir oppdaget, gjemt på toppen av en gotisk bygning som snart skal renoveres. Etterforsker Karen Pirie har som oppgave å identifisere flere tiår gamle bein og finner snart seg selv avdekke en serie gamle konflikter, falske identiteter og hemmeligheter som lenge har vært begravd.