"Submarino" er historien om to brødre som begge er preget av en tragisk hendelse fra barndommen. Ingen av dem klarer å gi slipp på den. Nick bor på et herberge i Københavns Nordvestkvarter. Han er sint, løfter vekter og drikker gulløl. Ikke en mann man skal gå i veien for. Nicks lillebror er alene med sin 6 år gamle sønn, som han forsøker å sikre en god oppvekst, midt i sin jakt på det neste heroinskuddet. En dag bestemmer Nick seg for å oppsøke broren, drevet av håpet om å bryte den onde sirkelen som har preget deres liv. Men er det mulig å forsone seg med fortiden?
