Den ettersøkte Johannes har flyktet til Rio de Janeiro, der han treffer en okkult prest som driver et hjem for misbrukte barn. Samtidig prøver samboeren til en av kvinnene som ble drept i "Lobotomisten" å finne Johannes for å hevne seg. Forfatteren arbeider som kriminaletterforsker ved Oslo politikammer. Dette er den andre boken om prestesønnen Johannes.
Pastorsønnen er tilbake. Heksedoktoren er en oppfølger til boken Lobotomisten. Den dypt religiøse Johannes som vi møtte i Lobotomisten har flyktet til Rio de Janeiro, der farens menighet driver et hjem for misbrukte barn i favelaen Santa Marta. Johannes føler seg sviktet av Gud og bestemmer seg derfor for å vende seg til Djevelen og de mørke religionene i slummen. Dette er hans opprør mot Gud og sin egen far som er pastor i pinsemenigheten. De som sviktet ham. Tom Stohl, samboeren til en av kvinnene som ble drept av Johannes i Lobotomisten finner ut at Johannes gjemmer seg i Rio de Janeiro og drar over Atlanteren for å finne ham. Når Tom ankommer slummen, tror han det bare er å spørre etter den hvite mannen. Det han ikke vet, er at Johannes har fått stor makt i slummen fordi han praktiserer svart magi. Det blir en dødelig jakt av voldsomme dimensjoner, hvor noen er dømt til å tape livet. Hvorfor begår mennesker ondskap? Troverdig, rått og annerledes.
